書斎のデスクトップPCに250GB SSDを導入

1年半前にAMD A10-5700をA10-6700Tに換装してからデスクトップPCの中身には手を加えていなかったのですが、OSをWindows10にアップグレードする際にHDDの換装をすることにしました。
これまで、デスクトップPCがWindows 7 Home Premiumで、ファイルサーバとしてのキューブPCがWindows 8.1 Proでした。
デスクトップPCのほうで色々と試したいので、デスクトップPCのほうをWindows 10 Pro、キューブPCのほうをWindows 10 Homeにしたいところです。
ゼロからインストールするのは面倒だったので、デスクトップPCのSSDをキューブPCに移動させて、デスクトップPCには新たに大容量SSDを入れてそこにキューブPCのHDDの中身をクローンして、それから必要なアプリケーションのインストールと設定の変更をすることにしました。
新しいSSDは冬のボーナスの後12月の中旬に購入していたのですが、なかなかまとまった時間が取れなくて、換装は年明けになってしまいました。

現在のハードウェア構成は以下のようになっています。

APUAMD A10-6700T(2.5GHz, L2:1MBx4, L3:なし, TDP:45W)
CPUクーラーサントラスト 薙刀+(なぎなたプラス)、ファンを鎌風の風PWM 9cm(2500rpm, 31.07dBA, 55.55CFM)に交換、MBのCPU Fan Speed Control機能で回転数を調整(500rpm~)
MBGIGABYTE GA-F2A85XM-D3H
メモリCRUCIAL DDR3-1866 8GB 2枚(合計16GB)
SSDTranscend SATA 6Gb/s 256GB SSD TS256GSSD370S(Cドライブ; システムドライブ)
HDDHGST SATA3 1TB 2.5" HDD GTS541010A9E680(QUIET DRIVEに収納; Dドライブ; データドライブ)
光学ドライブパイオニア BD/DVD/CDライター BDR-206JBK ブラック
サウンドオンボードサウンドを使用
ネットワーク機器オンボードLAN(1Gbps)を使用
ケースCoolerMaster Centurion 541 ブラック 電源無し
電源サイズ CORE POWER2 CoRE-400-2007
ケースファン後・上S-FLEX 12cm SFF21D(12cm, 800rpm, 33.5CFM, 8.7dBA)を排気設置、ファンコンで常時600rpm弱で稼働(参考:パソコンの静音化のために8cmファンを12cmファンに交換
ケースファン後・下Xinruilian 超極低速FAN RDL8025SX(8cm, 1200rpm, 14.89CFM, 12dBA)を排気設置、MBのSystem Fan Speed Control機能で回転数を調整(300rpm~)
ケース吸音材東京防音 シャットオンシート OS-14